تسعى الكلية في إطار الأهداف الكلية لوزارة التعليم العالي والبحث العلمي ورسالة الجامعة بغرض إعداد الكوادر الطبية وتطوير القدرات في تقديم الخدمات الصحية والعلاجية بولاية غرب دارفور وما جاورها من الولايات الأخرى وغرب السودان وذلك من خلال التدريس والبحث العلمي وخدمة المجتمع.